[ EP: 科学に佇む心と身体 ]

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生命を人工的に合成する:合成生物学

カテゴリ[科学に佇む2008年] 2008/06/13
「合成生物学  Synthetic Biology」に関する関係記事置き場です。

ひととおりのあらましはまずこちら。
→ 2007/10 『科学メモ:ベンターの生命合成報はフライング』

以下は、その後の拾いもの。

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2007/10 生命合成を推進するクレイグ・ベンター インタビュー
【動画】科学なムービー
【英語】 Bloggingheads A conversation with Craig Venter, genome pioneer
 October 28, 2007 (video podcast)

●右画
このdiavlogの全長は「49分20秒」、内容は
・クレイグ・ベンター(ヒト・ゲノムの立役者)をご紹介
 Introducing Craig Venter, the gold standard in human genomes (06:32)
・個人ゲノムをバーゲン価格で解析いたします
 Personal genome sequencing at bargain prices (05:16)
・ジャンクDNAの価値を発掘せよ
 Discovering the value of junk DNA (06:27)
・人工生命の作り方
 The recipe for artificial life (09:09)
・どうやってゲノムを移植するの?
 How to perform a genome transplant (07:39)
・「合成生物学」は、人類にとってどんな意味がある?
 What can synthetic biology do for humankind? (09:05)
・生命とは、なんぞや?
 What is life? (05:08)

リンク ビデオファイルのダウンロード: bhTV10157ZV.wmv (108.06 MB)
リンク 音声バージョンのダウンロード: bhTV10157ZV.mp3 (22.6 MB)

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合成生物学
2007/10 BBC News Creating life in the laboratory
研究所で生命を作成いたします
 生命バージョン2.0を作成する競争は、進行中である
 人工生命の完成間近にいるのはクレイグ・ベンターの研究チーム
 人工ゲノムはゼロから作成するのではない
 新生物を生み出すために、既存の微生物の遺伝子をいじっております
 生命維持に最低限必要なDNAを組み上げて、カラの細胞に挿入するのだ
 この究極にシンプルなゲノムは、シンプルなバクテリア(マイコプラズマgenitalium)の遺伝子をひとつひとつノックアウトしていった末に割り出したしろものなのである

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【podcast 音声】科学なポッドキャスト
【英語】Building Synthetic Genomes: Life from Scratch?
一から構築する合成ゲノム:生命をこしらえるクレイグ・ベンター
2008/01 サイエンス・フライデイ Science Friday

 ヒトゲノム解析のパイオニア、クレイグ・ベンター配下の科学者は、バクテリアのゲノムの人工コピーを構築した。
 新しい研究は、もう一つの段階をマークする。
 バクテリアの細胞に合成ゲノムを挿入し、人工生命を生み出すのだ。

◆ゲノムを支配する者は誰か◆Cracking the Genome
 「ゲノムを支配する者は誰か クレイグ・ベンターとヒトゲノム解読競争」 ケヴィン・デイヴィーズ著 日本経済新聞社 2001年
 原書と書評: Cracking the Genome 2001

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2008/01 【日本語記事】Science日本版 細菌ゲノムの合成に成功
●右画
 Scientists Create Synthetic Genome
 細菌 Mycoplasma genitalium の全ゲノム合成

2008/01 【日本語記事】ワイアードビジョン 細菌のゲノム合成に成功:2008年中に合成生命も?
2008/01 The Loom  Once Again, Breathe Into This Paper Bag  〜カール・ジンマー
「おいおい、いまさら騒ぐなよ」
2008/01 Wired Artificial Life? Old News

協力して縫い上げられた手作りゲノム
 科学者は、人工生命建築用ブロックを造る
2008/01 news@nature.com Genome stitched together by hand


... 以下つづき...

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2008/01 【日本語記事】毎日新聞  細菌ゲノム:合成成功 人工生命へ前進 米チーム
2008/01 【日本語記事】毎日新聞  <ゲノム>DNAを人工的に完全合成 米チームが成功
2008/01 【日本語記事】時事通信  細菌ゲノムを化学合成=「生物創造」に近づく実験も−米民間研究所
2008/01 【日本語記事】朝日新聞  細菌ゲノム、完全合成 米チーム「人工生命」に前進
2008/01 【日本語記事】読売新聞  細菌のゲノム合成に成功…米チーム 「人工生命体」研究進む

生命合成『進展』の報告
2008/01 BBC News Synthetic life 'advance' reported
全体を合成したゲノムが生み出される
2008/01 National Geographic Entire Synthetic Genome Created


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2008/01 【日本語記事】ワイアードビジョン ワイアードが初公開:合成ゲノムに隠された暗号を解読
●右画
J. Craig Venter Instituteがこのほど合成に成功したバクテリアのゲノムには、合成ゲノムと天然ゲノムを区別するための「透かし」が入っている

クレイグ・ベンターは合成した遺伝子にサインを入れていたぞ
2008/01 New Scientist Artificial letters added to life's alphabet
生命のアルファベットに追加される人工の文字
2008/01 New Scientist Gene pioneer signs his synthetic DNA creation
遺伝子先駆者は、彼の合成DNA創造物に署名していた


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合成生物学
2008/02 【日本語記事】Science 菌 Mycoplasma genitalium のゲノムの完全な化学合成、組立、クローニング
 Complete Chemical Synthesis, Assembly, and Cloning of a Mycoplasma genitalium Genome
 クレイグ・ベンター・チームの合成ゲノム
 M. genitalium JCVI-1.0と命名したこの合成ゲノムは、野生型M. genitalium G37のMG408遺伝子を除くすべての遺伝子を含んでいる。
 合成されたゲノムであることを認識するために、トランスポゾンが挿入可能であるとされている遺伝子間に「watermark(透かし)」を挿入した。

2008/02 AFP  http://news.yahoo.com/s/afp/20080228/ts_afp/scienceusitgenetics Famed geneticist creating life form that turns CO2 to fuel
J.クレイグ・ベンター博士曰く「二酸化炭素を食って燃料を生み出す生物を作りたい」

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【podcast 音声】科学なポッドキャスト
【英語】Constructing Life Creates Questions of Ethics
「生命を合成するという倫理問題」
 Scientists are getting closer to creating artificial life in the lab. But is society ready for custom-made organisms? Synthetic biology has the potential to dramatically change fields from agriculture to medicine to zoology. But what protections need to be in place as research proceeds?
2008-03-01 サイエンス・フライデイ Science Friday

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『人工の細胞』は、それ自身の遺伝子を作ることができる
2008/03 New Scientist 'Artificial cell' can make its own genes
郵便切手のサイズの機械は、速くて安い新しい方法を提供する
 自然界で発見されない「デザイナー」タンパク質
 それ自身の遺伝子を作って伝えることができる
 顕微鏡イメージは、機械のちっぽけなチャンネルで作成された蛍光性のタンパク質を示す
 そのマシンは、自身の遺伝子を合成して伝えることができる

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●右画
「合成生物学:その社会的・倫理的挑戦」
Synthetic Biology:social and ethical challenges
 ノッティンガム大 Andrew Balmer and Paul Martin
2008/06 EurekAlert Synthetic Biology: funders move to address social and ethical challenges
 公衆の許容範囲を越える研究はするな
 誇大広告や、過剰な不安醸成はやめろ
 応用に入る前に、現在の規制とガイドラインを見直しておけ


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cover
A Life Decoded

●解読された命:クレイグ・ベンター自伝
 Craig Venter
 Viking Pr (2007/10/18)
書籍情報と書評:アマゾン     .


生物学の未来について語るクレイグ・ベンター
 カール・ジンマー
2008/07 Carl Zimmer The Loom Clone Armies And Designer Life
 深海性の細菌から取った遺伝子で二酸化炭素を吸収し水素ガスを出させるとか、そんな一石二鳥とか
 合成ゲノムで細菌のを置換するのは今年中にできればいいな
 皮膚の色でゲノムの違いを見ようとする者はかなり粗忽だろう
 ワトソンのゲノムに黒人の要素があった件については、ワトソンの祖父母にはそんな様子はなかったわけで、ベンターは親子つながりに関して遺伝子検査をしたほうがいいんじゃないかとワトソンに進言したらしい。

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希望と懸念
2008/11 PhysOrg Conference explores hot new field of synthetic biology
合成生物学のホットな新分野を調査する会議がベイエリアで開かれた

2008/11 EurekAlert Synthetic virus supports a bat origin for SARS
合成ウイルスは、SARSがコウモリから来たことを示す
 SARSっぽいコウモリ・コロナウイルスを作製してみました

2008/12 Discovery Venter Lab Makes Progress on Artificial Life
ベンター・ラボの生命合成研究
2008/12 PhysOrg Scientists get closer to creating artificial life: study
人工生命の創生に一歩近づく科学者

ベンターも生命合成に用いている手法
2008/12 ABC@オーストラリア Yeast assembles synthetic genome
酵母菌は、合成ゲノムを組み立てる
 人工生命を生み出す合成ゲノムを構築するより効率的な方法
 以前は大腸菌を使っていたのだけれど、これがまた面倒でね

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この箇所へのリンク【2009年の合成生物学】


合成生物学:自然の陰陽
2009/01 Nature Synthetic biology: The yin and yang of nature
いろいろな細胞のプロセスを制御する遺伝子表現型における振幅は、強いと同時に調整可能でなければならない。
ネガティブとポジティブのフィードバック・ループとの相互作用は、これらの特徴を確実にするようである。
Jeff Gore and Alexander van Oudenaarden
doi:10.1038/457271a
生理:哺乳類の調節可能な合成振動子
2009/01 Nature A tunable synthetic mammalian oscillator
doi:10.1038/nature07616
2009/01 【日本語記事】Nature 細胞:概日周期で働く合成回路
自律的で自動持続可能であり、しかも調節可能な周期的遺伝子発現を生じる合成センス-アンチセンス回路。
2009/01 news@nature.com Genetic 'clock' made in lab
Synthetic metronome keeps time inside mammalian cells.
研究室で作られる遺伝子『時計』
合成のメトロノームは、時間を哺乳類の細胞に保つ。

David Deamer
2009/02 EurekAlert Synthetic biology yields clues to evolution and the origin of life
合成生物学は、進化の手がかりと生命の起源を生ずる
 {生命が地球上で開始した} 方法のミステリーの手がかり
 40億年前最初の「プロトセル」に至った分子の自己集合プロセス

2009/02 EurekAlert Milestone achieved toward production of malaria treatment using synthetic biology and fermentation
合成生物学と発酵を使用して、マラリア治療薬の大量生産へ一歩近づく
 大腸菌発酵を通して達成されるamorphadieneの25g/Lの増大された生産

2009/02 Discovery Synthetic Life Form Grows in Fla. Lab
合成生物は、フロリダの研究室で育っております

2009/03 EurekAlert Synthetic biology: The next biotech revolution is brewing
合成生物学:次のバイテク革命は、起ころうとしている
 合成生物学が熟する前に、議会や政策担当者は、考慮すべきである
 新しく収斂していくテクノロジーの調節をどのように合理化・現代化するべきか

2009/04 EurekAlert UI chemists' DNA biosynthesis discovery could lead to better antibiotics
化学者によるDNA合成の発見から、より良い抗生物質の発見を目指す

2009/04 EurekAlert Using combinatorial libraries to engineer genetic circuits advances synthetic biology
遺伝子回路を組み替えるために組合せライブラリを使用することで、期待される合成生物学の進展

合成生物学に、倫理指針
 英国センターは、期待する ―科学、政策と伸びゆく分野をブレンドするために。
2009/05 Nature Synthetic biology gets ethical
 UK centre hopes to blend science, policy and outreach in burgeoning field.

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 以上、
→ 2007/10 『科学メモ:ベンターの生命合成報はフライング』
の続きの記事たちでした。

 新しい記事が出れば適宜追記していきます。




メタル


[カテゴリ 科学に佇む2008年] : 2008年06月13日 
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